1205 – I veneziani occuparono Creta e per la sicurezza del porto di Kandia, come si chiamava all'epoca l'odierna Heraklion, decisero di costruire delle fortificazioni.
1303 – Un forte terremoto causò un grande tsunami e distrusse il faro che i veneziani avevano costruito sul lato nord-occidentale del porto di Heraklion.
1508 e 1512 – Due nuovi terremoti fecero crollare il secondo faro, che era stato costruito al posto del primo. Quindi, fu deciso di costruire un forte.
1530-1540 – Così durarono i lavori di costruzione della fortezza. La fortezza fu chiamata Rocca Al Mare. Fu costruita su uno sperone roccioso naturale e per rafforzare la base sottomarina, vecchie galee furono riempite di rocce, ghiaia e massi e furono affondate sul posto. Il forte occupa un'area di 3600 m2, ha due piani e la larghezza delle pareti esterne raggiunge gli 8,7 m. All'interno del forte, c'erano 26 appartamenti diversi che fungevano da aree di stoccaggio per cibo, munizioni, cisterne per l'acqua piovana e prigioni. Al piano terra, c'erano 18 cannoni e 25 al primo piano. C'erano tre porte d'ingresso, a ovest, a nord-ovest e a sud-ovest. All'esterno, dominano i rilievi in marmo raffiguranti il leone alato di San Marco, simbolo di Venezia.
1552- Il molo sul lato nord crollò a causa dell'usura delle onde.
1556- Il molo fu ricostruito.
1558- Una parte significativa del molo fu nuovamente distrutta.
1566- Fu proposto un muro inclinato per proteggere meglio la fortezza dalle onde.
1570- Furono creati nuovi fori nel molo e le riparazioni continuarono.
1648- Gli Ottomani occuparono Creta e chiamarono la fortezza Su Kulesi.
1649- Gli Ottomani continuarono le riparazioni e usarono la fortezza esclusivamente come prigione per i ribelli cretesi.
1700- Un'altra torre più piccola, nota anche come Mikros Koules (piccola fortezza), fu costruita sul lato orientale del porto, nel luogo in cui oggi si trova il Marina Cafe. Mikros Koules fu demolita nel 1936 per la costruzione del nuovo porto di Heraklion.
1719- Parte del lato nord-occidentale di Koules crollò ma fu nuovamente riparata.
1830-1840 Gli egiziani dominarono Creta e costruirono un faro sul lato nord-orientale della fortezza, che fu distrutto durante la seconda guerra mondiale.
1959- Iniziarono le riparazioni del forte.
1972-1975- La fortezza di Koules fu trasformata in un monumento visitabile. Oggi, il suo museo espone reperti provenienti dai relitti dell'ammiraglia La Theresse, affondata il 24/07/1669 durante la guerra di Creta, e dai relitti minoici trovati sull'isola di Dia. Inoltre, il luogo è utilizzato per mostre d'arte, spettacoli teatrali e vari eventi culturali.
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